Sale alla ribalta internazionale agli Europei di Sheffield 1993, quando vince l'oro nei 200m farfalla e nella staffetta 4x100m misti più un argento nei 100m farfalla.

Ai Mondiali di Roma del 1994 si afferma definitivamente conquistanto il titolo iridato nei 200m farfalla. Arrivano anche due argenti nelle staffette (4x100m misti e 4x200m sl) e un bronzo nei 100m farfalla.

Ai campionati europei del 1995 a Vienna Pankratov è il dominatore assoluto. Giunge al primo posto, infatti, nei 100m e 200m farfalla e nella staffetta russa 4x100m misti.

Il 1996 è l'anno del grande appuntamento olimpico di Atlanta. Il talento russo arriva negli States in ottima forma e conquista due medaglie d'oro nei 100m e 200m farfalla, con l'aggiunta di un prezioso argento nella 4x100m misti.

Dopo i giochi olimpici perde un po' gli stimoli e i suoi risultati ne risentono. Fa in tempo a conquistare un altro argento con la staffetta russa 4x100m misti ai Mondiali in vasca corta di Goteborg 1997.

Pankratov è stato detentore del record mondiale sia nei 100m che nei 200m farfalla. Dopo il suo ritiro è diventato membro della International Swimming Hall of Fame.